Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN2P35609 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms