Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms