Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL9P32969 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL9P32969 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL9P32969 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL9P32969 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL9P32969 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL9P32969 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL9P32969 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL9P32969 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL9P32969 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL9P32969 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms