Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 OR4A48P-201ENST00000531359 391 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms