Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms