Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms