Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND3P30281 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND3P30281 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND3P30281 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCND3P30281 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCND3P30281 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCND3P30281 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCND3P30281 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND3P30281 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND3P30281 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND3P30281 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND3P30281 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND3P30281 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND3P30281 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND3P30281 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCND3P30281 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms