Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms