Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms