Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms