Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LOXP28300 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LOXP28300 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LOXP28300 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LOXP28300 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
LOXP28300 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LOXP28300 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LOXP28300 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXP28300 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXP28300 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXP28300 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXP28300 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXP28300 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LOXP28300 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms