Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms