Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GADD45AP24522 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GADD45AP24522 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GADD45AP24522 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GADD45AP24522 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms