Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CA4P22748 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CA4P22748 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CA4P22748 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA4P22748 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA4P22748 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms