Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BGNP21810 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BGNP21810 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BGNP21810 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BGNP21810 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BGNP21810 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BGNP21810 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BGNP21810 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BGNP21810 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms