Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms