Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms