Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms