Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms