Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFTRP13569 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CFTRP13569 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CFTRP13569 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFTRP13569 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFTRP13569 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFTRP13569 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFTRP13569 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFTRP13569 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFTRP13569 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CFTRP13569 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFTRP13569 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFTRP13569 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFTRP13569 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFTRP13569 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFTRP13569 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CFTRP13569 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFTRP13569 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFTRP13569 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFTRP13569 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CFTRP13569 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFTRP13569 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFTRP13569 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CFTRP13569 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CFTRP13569 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFTRP13569 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFTRP13569 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFTRP13569 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms