Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARBP10826 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARBP10826 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARBP10826 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARBP10826 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARBP10826 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARBP10826 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARBP10826 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARBP10826 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms