Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD28P10747 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD28P10747 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD28P10747 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD28P10747 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms