Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms