Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms