Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
POLA1P09884 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
POLA1P09884 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
POLA1P09884 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
POLA1P09884 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
POLA1P09884 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
POLA1P09884 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLA1P09884 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLA1P09884 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLA1P09884 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLA1P09884 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLA1P09884 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLA1P09884 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLA1P09884 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLA1P09884 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLA1P09884 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLA1P09884 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLA1P09884 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLA1P09884 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLA1P09884 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
POLA1P09884 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLA1P09884 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLA1P09884 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLA1P09884 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLA1P09884 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
POLA1P09884 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
POLA1P09884 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
POLA1P09884 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
POLA1P09884 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms