Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTAP09496 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTAP09496 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTAP09496 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTAP09496 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTAP09496 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLTAP09496 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLTAP09496 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTAP09496 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTAP09496 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTAP09496 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTAP09496 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTAP09496 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTAP09496 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTAP09496 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLTAP09496 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLTAP09496 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLTAP09496 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLTAP09496 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLTAP09496 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTAP09496 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms