Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PKHD1P08F94 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PKHD1P08F94 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PKHD1P08F94 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PKHD1P08F94 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PKHD1P08F94 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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