Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP3P08254 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MMP3P08254 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP3P08254 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms