Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOP08100 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOP08100 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RHOP08100 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOP08100 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOP08100 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms