Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM2P07951 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM2P07951 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM2P07951 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM2P07951 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM2P07951 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM2P07951 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM2P07951 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM2P07951 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM2P07951 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM2P07951 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM2P07951 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM2P07951 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM2P07951 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM2P07951 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM2P07951 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM2P07951 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM2P07951 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms