Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB3P05106 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms