Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGAP02671 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGAP02671 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGAP02671 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGAP02671 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGAP02671 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGAP02671 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGAP02671 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGAP02671 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGAP02671 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGAP02671 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FGAP02671 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGAP02671 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGAP02671 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGAP02671 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms