Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGKV1-5P01602 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms