Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSP01100 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOSP01100 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOSP01100 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOSP01100 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSP01100 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSP01100 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSP01100 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSP01100 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSP01100 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms