Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX7O95931 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX7O95931 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX7O95931 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX7O95931 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX7O95931 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX7O95931 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX7O95931 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX7O95931 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX7O95931 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX7O95931 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX7O95931 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX7O95931 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX7O95931 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms