Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms