Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB11O95342 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB11O95342 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms