Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP19O94966 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP19O94966 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP19O94966 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP19O94966 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP19O94966 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP19O94966 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP19O94966 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP19O94966 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP19O94966 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP19O94966 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP19O94966 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP19O94966 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP19O94966 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP19O94966 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms