Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3JO75822 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3JO75822 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms