Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms