Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4AO75164 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms