Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF40O75150 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF40O75150 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF40O75150 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF40O75150 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF40O75150 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms