Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
ABCC9O60706 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms