Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIAA0556O60303 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms