Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms