Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms