Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms