Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSH5O43196 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSH5O43196 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MSH5O43196 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MSH5O43196 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSH5O43196 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSH5O43196 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms