Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEFVO15553 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEFVO15553 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEFVO15553 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MEFVO15553 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEFVO15553 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms