Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms